QSAR
定性(量)构效关系,是使用数学模型来描述分子结构和某种生物活性之间的关系。这种关系,通常用一种算法将分子结构和分子的生物活性关联起来,比如线性回归、神经网络、支持向量机、遗传算法、决策树等等。简单的说,就是通过一些计算机模型来推测物质的某些性质或者活性。
在实际应用中,选择合适的、预测性能好、被验证过的模型去预测未知化合物的某种生物活性,显得尤为关键,且不同模型或方法获得的生物活性结果之间可以相互验证最为理想。当然如果您拥有足够多的样本数据(训练集),您也可使用现有的一些QSAR软件进行建模、模型验证,然后用于未知化合物的生物活性的预测。
现阶段常用的QSAR软件有诸如OECD Toolbox、TOPKAT、Discovery Studio、SYBLE、ACD/Labs、Multicase、EPI SUITE、ECOSAR等等。
物质分组(Grouping/Category)和交叉参照法(READ-ACROSS)
利用了结构相近、性质相似的原理,将某些由于结构相似而遵循某个规则的物质,归为一组(group),或一“类”(category)。通过在组内插入其他参考物质,利用“组”内各参考物质的现有数据,通过交互参照的方式(READ-ACROSS),预测其他物质缺失的理化、毒理或生态毒理性质,从而避免每种物质的每个性质进行测试的需求,节约数据成本。
以上图解为下图所示。- 体外测试方法
常用的有眼刺激、皮肤刺激和皮肤致敏。
皮肤刺激/腐蚀有:OECD439、OECD430、OECD431和OECD435。
眼刺激有:OECD 437、OECD438和OECD460。
皮肤变态反应试验:OECD442C、OECD442D、H-CLAT。
体外测试方法在不同的法规体系中的认可度不同,如EU REACH和中国新物质申报就不同,需要具体分析。
- 证据权重(Weight of Evidence, WOE)
当某项从每个毒理数据源得到的数据被认为不足以支持某个观点时,则从若干个独立的数据源得到的综合证据可能具有足够的权重,将对该物质有某项特殊的危险特性做出假设或结论。
我们的服务:
(1)建QSAR模型,进行目标物质的理化、毒理、生态毒理性质估算,并撰写专业的QMRF和QPRF报告;
(2)应用受国际认可的商业软件估算目标物质的某项理化、毒理或生态毒理性质,如TOPKAT 、ACD/Labs、Discovery Studio等等,并撰写专业的QMRF和QPRF报告;
(3)查阅权威数据库,利用READ ACROSS或是Grouping方法,填补数据空缺;
(4)体外测试方法咨询顾问;
(5)利用WOE法撰写评估报告,用于各项理化、毒理、生态毒理性质的预测,进而用于各国化学品法规注册或是其他如农药、化妆品法规等方面。
我们的优势:
- 拥有专业的计算机模拟科研团队,有教授、博士、硕士团队;
- 拥有数年的QSAR、READ-Across、WOE的化学品法规运用,如EU REACH、中国新物质申报的成功经验,并获专家评审委员会认可,成功率>90%;
- 成功QSAR案例包括:理化性质如熔沸点、溶解度、正辛醇水分配系数、logKoc;健康毒理方面如ADME等的预测;生态毒理方面,如藻、溞、鱼急性毒性、快速生物降解、生物富集,等等。还有通过其他非测试方法(如体外、WOE、READ-ACROSS等)豁免的许多理化、毒理、生态毒理数据成功案例。
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